Bezpečnostná skriňa triedy III poskytuje absolútne bezpečnostné záruky, ktoré bezpečnostné skrine triedy I a triedy II nemôžu poskytnúť. Všetky biologické bezpečnostné skrine triedy 3 sú úplne uzavreté. Experiment bol vykonaný úplne cez rukavice na prednom okne. Počas každodennej prevádzky bude vnútorná časť skrinky vždy udržiavať podtlak. Dokonca aj v prípade zlyhania systému prevencie fyzického znečistenia môže.
Všetky biologické bezpečnostné skrine triedy 3 sú chránené čistým vzduchom filtrovaným filtrom HEPA a zabraňujú krížovej kontaminácii vzoriek. Výfukový plyn sa zvyčajne filtruje cez HEPA. Alebo použite dva filtre HEPA vedľa seba. Položky požadované pre experiment boli vložené do skrine spolu s izolačným kanálom umiestneným na boku skrinky. Bezpečnostné skrine úrovne 3 zvyčajne nasmerujú výfukový plyn do laboratória. Avšak vzduch môže byť tiež vypúšťaný priamo do vonkajšieho prostredia prostredníctvom vonkajšieho výfukového potrubia. Pri použití výfukového potrubia je trojúrovňová bezpečnostná skriňa vhodná aj pre mikrobiologické operácie, ktoré vyžadujú pridanie toxických chemikálií počas testu. Všetky biologické bezpečnostné skrine triedy 3 sa môžu použiť v experimentoch mikrobiologických faktorov zahŕňajúcich úrovne biologickej bezpečnosti na úrovni jedna, dve, tri a štyri.